AarI
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝規(guī)格 | 價格 |
NBS8216 | AarI | 100 U | 600 |
產(chǎn)品簡介:
AarI屬于Type IIS型限制酶,是PaqCI的完全同裂酶,識別CACCTGC序列并在其下游進行切割,形成4堿基的5'突出。不同于常規(guī)的Type IIS限制酶,AarI酶切需要兩個或兩個以上識別位點,搭配隨酶附贈的激活劑可實現(xiàn)完全酶切,在沒有激活劑的情況下可以酶切,但無法酶切完全。AarI的識別序列長達7堿基,在基因中的出現(xiàn)頻率較低,尤其適合用于Golden Gate組裝。
識別位點:
CACCTGC(4/8)
5'...C A C C T G C (N)?↓...3'
3'...G T G G A C G (N)?↑...5'
同裂酶:PaqCI
注:同裂酶對于不同的甲基化修飾可能具有不同敏感性。
產(chǎn)品組成:
組分 | 規(guī)格 |
AarI (5 U/μl) | 20 μl |
AarI Activator | 20 μl |
10× FastCut Buffer | 1 ml |
10× FastCut Color Buffer | 1 ml |
保存條件:
-20℃保存,2年有效。
建議反應(yīng)條件:
1× FastCut 緩沖液;
37℃溫育;
參照“DNA酶切流程”配制反應(yīng)體系。
失活條件:
80℃溫育20 min。
甲基化敏感性:
對于被 CpG 甲基化的 DNA,剪切可能受阻。
活性定義:
1活性單位 (U) 是指在激活劑存在下,50 μl反應(yīng)體系中,37℃ 1 h 內(nèi)完全酶切1 μg λDNA 所需的酶量。
功能活性檢測:
37℃下,5 U AarI能夠在1 h 內(nèi)完全消化1 μg p615 DNA。
超長時間溫育檢測:
37℃下,將5 U AarI與1 μg p615 DNA共同溫育3 h,未檢測到其他核酸酶污染或星號活性引起的底物非特異性降解。延時酶切可能出現(xiàn)星號活性。
酶切-連接-再酶切檢測:
37℃下,使用5 U AarI消化底物,回收酶切產(chǎn)物。在22℃下使用適量 T4 DNA Ligase (Fast)可以將超過95%酶切產(chǎn)物重新連接。將連接產(chǎn)物再次回收后,使用相同的內(nèi)切酶可以重新切開約95%以上的連接產(chǎn)物。
使用方法:
1. DNA酶切流程
① 在冰上按如下建議的加樣順序配制反應(yīng)體系:
ddH2O | up to 50μl |
10× FastCut Buffer 或 10× FastCut Color Buffer | 5μl |
底物DNAa | 1μg |
AarI (5 U/μl) | 1μl |
AarI Activatorb | 1μl |
Total | 50μl |
a. DNA底物中應(yīng)不含苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、洗滌劑或高濃度鹽,否則將會影響AarI酶活性;
b. AarI完全酶切需要按1:1的比例加入和酶體積一致的激活劑,激活劑在電泳時表現(xiàn)為幾十bp左右的條帶,請避免誤判為非特異性切割。
② 輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時離心以收集掛壁液滴;
③ 37℃溫育1~3 h;
④ 80℃溫育20 min即可使酶失活,停止反應(yīng),或者通過吸附柱或苯酚/氯仿純化終止反應(yīng)。
不同DNA中的酶切位點數(shù)量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
12 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 9 |
甲基化修飾影響
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
無影響 | 無影響 | 剪切受影響 | 無影響 | 無影響 |
在不同反應(yīng)緩沖液中的活性
FastCut Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB rCutSmart? Buffer | Takara QuickCut? Buffer | |
活性 | 100% | <12.5% | 100% | <12.5% |
注:活性數(shù)據(jù)來自限制酶標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系下的檢測。
注意事項:
1. AarI是PaqCI的完全同裂酶;
2. AarI完全酶切需要兩個或兩個以上識別位點;
3. 反應(yīng)體系中加入的酶體積不應(yīng)超過總體積的10%,避免酶中過多的甘油引起星號活性;
4. 限制性內(nèi)切酶存儲緩沖液中的添加劑(例如甘油、鹽)與底物溶液中的污染物(例如鹽、EDTA或乙醇等)相同,反應(yīng)體積越小,酶切反應(yīng)抑制效應(yīng)越強;
5. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
本產(chǎn)品僅用于生命科學(xué)研究,不得用于醫(yī)學(xué)診斷及其他用途!
相關(guān)常規(guī)限制性內(nèi)切酶產(chǎn)品:
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝規(guī)格 |
100 U | ||
500 U | ||
50 U | ||
250 U | ||
300 U | ||
200 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
200 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
1000 U | ||
500 U |