Hoechst染料是用于顯微觀察標記DNA的熒光染料,常用于細胞核和線粒體顯像。Hoechst 33258和Hoechst 33342是兩種常用染料,均在350nm激發,461nm處發射藍/青色熒光。Hoechst 33342因含乙基,親脂性更強,能更好透過細胞膜,而Hoechst 33258在某些細胞中滲透性較弱。它們可用于活細胞或固定化細胞,常代替DAPI等核酸染料。此外,Hoechst染料還能檢測樣品DNA含量,通過繪制標準曲線分析。Hoechst 33342常用于細胞凋亡檢測,染色后可通過熒光顯微鏡或流式細胞儀檢測,激發和發射波長分別為350nm和460nm,嵌入雙鏈DNA后釋放強烈藍色熒光。